20 เครื่องมือโอเพนซอร์ซสามารถช่วย COVID-19 Cure Research

รัฐบาลนักวิทยาศาสตร์และสถาบันวิจัยต่างกำลังใช้เทคโนโลยีและนวัตกรรมเพื่อแก้ไขปัญหา COVID-19.


เครื่องมือโอเพนซอร์สได้รับการพัฒนาและบางส่วนยังคงได้รับการทดสอบเพื่อสนับสนุนความพยายามที่ได้รับการปรับใช้เพื่อลดผลลัพธ์ของไวรัสร้ายแรงนี้.

มีเครื่องมือโอเพนซอร์ซอยู่ในสถานที่ช่วยให้นักวิจัยเรียนรู้เกี่ยวกับโรคระบุการแพร่กระจายป้องกันการแพร่กระจายและลดการแพร่กระจายและการเสียชีวิตต่อไป ช่วงของโครงการที่มีอยู่ใน ระบบนิเวศการศึกษา ซึ่งสรุปวิธีการใช้เครื่องมือต่าง ๆ.

บทความนี้จะกล่าวถึงเครื่องมือและไลบรารีโอเพ่นซอร์สบางส่วนที่ใช้ในการตรวจสอบการป้องกันและการกักกันการวินิจฉัยและการรักษา COVID-19.

แผนที่การติดตาม COVID-19

ในเดือนมกราคมศูนย์วิทยาศาสตร์และวิศวกรรมระบบของ JHU ได้เปิดตัว COVID-19 แผนที่ติดตามทั่วโลก ที่กลายเป็นแหล่งข้อมูลที่เชื่อถือได้ในระดับสากลในการพัฒนาข้อมูลการระบาดใหญ่แบบเรียลไทม์.

แผนที่นี้เป็นโอเพ่นซอร์สและถูกนำไปใช้ในการวิจัยพลังงานและการสร้างภาพโดยองค์กรสื่อชั้นนำองค์กรขนาดเล็กและรัฐบาลท้องถิ่น.

DXY-COVID-19-ตีนตะขาบ

DXY-COVID-19-Crawler เป็นหนึ่งในโครงการโอเพ่นซอร์สที่เร็วที่สุดที่พัฒนาขึ้นเพื่อตอบสนองต่อ COVID-19 ในเดือนมกราคม.

นักพัฒนาใช้ประโยชน์จากข้อมูลจาก DXY.cn ซึ่งเป็นเว็บไซต์ที่แพทย์ชาวจีนใช้ในการรายงานและติดตามคดี พวกเขาพัฒนาโปรแกรมรวบรวมข้อมูลเว็บที่รวบรวมข้อมูลจากเว็บไซต์และทำให้สามารถใช้งานได้ผ่าน API และคลังข้อมูล รหัสมีอยู่ใน Github.

เปิดชุดข้อมูล

ชุดข้อมูลเปิด (ODK) ไม่ใช่เครื่องมือใหม่ มันถูกใช้มาก่อนในช่วงการระบาดของโรคอีโบลาในแอฟริกาตะวันตกในปี 2004 และการระบาดล่าสุดในสาธารณรัฐประชาธิปไตยคองโกในปี 2019.

ส่วนใหญ่จะช่วยให้ผู้ใช้รวบรวมจัดการและใช้ข้อมูลในการติดตามผู้ติดต่อการทำแผนที่เชิงกลยุทธ์การสนับสนุนการตัดสินใจการทำให้แพ้ในชุมชนและการจัดการเคส.

ชุมชน ODK มีการใช้งานขั้นสูงต่อไปเพื่อตอบสนองต่อ COVID-19 ด้วยการจัดทำแบบฟอร์มการรายงานในการปรับใช้ แบบฟอร์มดังกล่าวได้รับการออกแบบตามโปรโตคอลขององค์การอนามัยโลกสำหรับการสืบสวนกรณีและการติดตามการติดต่อและการสอบสวน.

นักพัฒนานำยังให้การสนับสนุนฟรีสำหรับองค์กรใด ๆ ที่ปรับใช้ ODK เพื่อตอบสนองต่อ COVID-19.

Nextstrain

Nextstrain ติดตามวิวัฒนาการของเชื้อโรค ก่อนหน้านี้เคยถูกใช้เพื่อหาประวัติครอบครัวของโรคดังนั้นจึงสามารถคาดการณ์ความก้าวหน้าของโรคได้.

มันถูกใช้อย่างประสบความสำเร็จในการระบาดครั้งก่อนเช่น Ebola จากข้อมูลทางพันธุกรรมจาก Global Initiative ในการแบ่งปันข้อมูลไข้หวัดใหญ่ทั้งหมด (Gisaid) จะใช้ Nextxtrain เพื่อจัดการ COVID-19.

DHIS2

คุณคงรู้แล้ว DHIS2. เป็นระบบการจัดการข้อมูลด้านสุขภาพที่ใหญ่ที่สุดในโลก มันถูกใช้ในกว่า 70 ประเทศทั่วโลก ส่วนหนึ่งของการตอบสนองต่อ COVID-19 นั้น DHIS2 ได้เปิดตัวแพ็คเกจข้อมูลดิจิตอลที่ช่วยเร่งการตรวจจับการติดเชื้อการรายงานการเฝ้าระวังและการรักษาโรค.

แพ็คเกจข้อมูลดิจิตอล DHIS2 ใช้ประโยชน์จากข้อมูลเมตามาตรฐานที่สอดคล้องกับโพรโทคอลของ WHO ในคำจำกัดความของเคสและการเฝ้าระวัง COVID-19 เพื่อเปิดใช้งานการตอบสนองอย่างรวดเร็ว.

Pikobar ชวาตะวันตก

ศูนย์ข้อมูลและประสานงานโรคและภัยพิบัติของอินโดนีเซียเป็นศูนย์ตอบโต้วิกฤตที่จัดตั้งขึ้นเพื่อบรรเทาและตอบสนองต่อ COVID-19 ในจังหวัดชวาตะวันตกของอินโดนีเซีย.

Jabar Digital Service ได้พัฒนาส่วนหนึ่งของการตอบสนอง เครื่องมือและแอปเว็บโอเพนซอร์ส ที่ช่วยให้ผู้ใช้สามารถเข้าถึงข้อมูล COVID-19 ล่าสุด.

OpenMRS

OpenMRS เป็นระบบการดูแลผู้ป่วยที่ใช้ในประเทศกำลังพัฒนาหลายแห่งทั่วโลก เนื่องจากความยืดหยุ่นของ ระบบ OpenMRS, ประเทศที่มีทรัพยากรด้านการดูแลสุขภาพของพวกเขาเครียดสามารถใช้มันสำหรับการเฝ้าระวังการคัดกรองและการรักษา COVID-19.

ระบบสามารถช่วยให้พวกเขาขยายขีดความสามารถโดยให้พวกเขาสามารถเข้าถึงข้อมูลบนพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ในการจัดการกับวิกฤต.

OpenLMIS

โครงการ OpenLMIS ใช้กลยุทธ์ที่มุ่งเน้นชุมชนเพื่อพัฒนาโอเพนซอร์ซและระบบข้อมูลการจัดการโลจิสติกส์ที่ปรับได้ ระบบ OpenLMIS พยายามที่จะปรับปรุงความถูกต้องของข้อมูลเพิ่มความรับผิดชอบตรวจสอบปรับปรุงความทันเวลาของข้อมูลและการมองเห็น.

ระบบ OpenLMIS พยายามที่จะปรับปรุงห่วงโซ่อุปทานด้านสุขภาพสินค้าคงคลังของทรัพยากรทางการแพทย์เพื่อให้ภาพที่ชัดเจนของอุปกรณ์การแพทย์ที่มีอยู่รวมถึงชุดทดสอบและ PPEs (อุปกรณ์ป้องกันส่วนบุคคล) เครื่องมือนี้สามารถปรับใช้อย่างมีประสิทธิภาพเพื่อสนับสนุนผู้มีอำนาจตัดสินใจในการจัดสรรทรัพยากรเพื่อตอบสนองต่อ COVID-19.

Healthsites

โครงการจัดทำแผนที่เว็บไซต์สุขภาพระดับโลก เป็นโครงการที่มุ่งทำแผนที่สถานพยาบาลทุกแห่งในโลกและทำให้รายละเอียดของโรงพยาบาลทุกแห่งเข้าถึงได้ง่าย ข้อมูลเกี่ยวกับสิ่งอำนวยความสะดวกด้านสุขภาพนั้นสามารถเข้าถึงได้ผ่าน API.

โดยการร่วมมือกับผู้ใช้ทีม healthsites.io จะรวบรวมและตรวจสอบสถานที่และรายละเอียดการติดต่อของสถานบริการสุขภาพแต่ละแห่งและทำให้ข้อมูลสามารถใช้ได้อย่างอิสระและสามารถเข้าถึงได้ผ่านทาง Open Data License.

SORMAS

SORMAS (ระบบการจัดการและวิเคราะห์การตอบสนองต่อการแพร่ระบาดของการเฝ้าระวัง) เป็นระบบ e-health มือถือโอเพนซอร์ซ มันถูกใช้งานเพื่อใช้การควบคุมโรคเช่นเดียวกับขั้นตอนการจัดการการระบาด.

มันได้รับการใช้งานอย่างมีประสิทธิภาพในหลายประเทศรวมถึงกานาไนจีเรียเนปาลและฟิจิสำหรับการเฝ้าระวัง COVID-19 และการตรวจจับเบื้องต้น.

SORMAS เป็นระบบโอเพ่นซอร์สฟรีที่เป็นไปตามมาตรฐานการปกป้องข้อมูล.

โตเกียว COVID-19

ไม่เหมือนเมืองและรัฐบาลอื่น ๆ อีกมากมาย กรุงโตเกียว ได้พัฒนาเว็บไซต์โอเพ่นซอร์สที่แจ้งให้ผู้อยู่อาศัยทราบเกี่ยวกับ COVID-19 ด้วยการทำให้เป็นโอเพนซอร์ซไซต์จึงได้รับการสนับสนุนจากผู้ใช้มากกว่า 200 ราย เมืองอื่นอีกสามเมือง ได้แก่ ชิบะนากาโนะและฟุกุโอกะได้สร้างเว็บไซต์ขึ้นใหม่.

OpenELIS

วัตถุประสงค์ของการ ระบบสุขภาพของ OpenELIS คือการปรับปรุงการดูแลสุขภาพด้วยการนำเสนอระบบการจัดการข้อมูลห้องปฏิบัติการตามมาตรฐานที่สามารถใช้งานได้โดยการริเริ่มด้านสุขภาพต่างๆเพื่อปรับปรุงทางเลือกในการรักษา.

การระบาดของ COVID-19 ได้นำเสนอความท้าทายระดับโลกในการติดตามการติดต่อและการทดสอบจำนวนมากของคดีที่น่าสงสัย ระบบ OpenELIS สามารถใช้งานได้อย่างมีประสิทธิภาพในการแก้ปัญหา COVID-19 เพื่ออำนวยความสะดวกในการติดตามผลการทดสอบในห้องปฏิบัติการและผลลัพธ์.

ชุดเครื่องมือสุขภาพชุมชน

ชุดเครื่องมือสุขภาพชุมชน เป็นชุดของเครื่องมือโอเพนซอร์สเช่นเดียวกับทรัพยากรการเข้าถึงแบบเปิดที่มีเป้าหมายเพื่อสร้างและปรับใช้เครื่องมือดิจิตอลสำหรับใช้ในโครงการด้านสุขภาพชุมชนในพื้นที่ที่เข้าถึงได้ยาก.

ชุมชนนักพัฒนาชุดเครื่องมือสุขภาพชุมชนได้ระดมกำลังเพื่อพัฒนาเครื่องมือและทรัพยากรที่มุ่งสนับสนุนผู้ปฏิบัติงานด้านสุขภาพชุมชนในการแก้ไขปัญหา COVID-19.

CHIME

COVID-19 แบบจำลองผลกระทบของโรงพยาบาลสำหรับโรคระบาด (CHIME) เป็นแอปพลิเคชั่นโอเพนซอร์ซที่พัฒนาโดยนักวิทยาศาสตร์ด้านข้อมูลของ Penn Medicine – University of Pennsylvania เป็นเครื่องมือออนไลน์ที่อนุญาตให้โรงพยาบาลทำนายผลกระทบของไวรัสที่มีต่อทรัพยากรด้านการดูแลสุขภาพ.

มันได้รับการพัฒนาโดยใช้ Python และการพึ่งพาโอเพนซอร์สของหมีแพนด้า.

แผนที่การดูแล COVID

แผนที่การดูแล COVID ช่วยในการทำแผนที่ทรัพยากรด้านการดูแลสุขภาพที่มีอยู่แล้วและในการพยากรณ์ช่องว่างในเตียงในโรงพยาบาลเครื่องช่วยหายใจเวชภัณฑ์และพนักงาน วิธีการเครื่องมือการประมวลผลข้อมูลการสร้างภาพและรหัสต้นฉบับทั้งหมดนั้นฟรีและโอเพ่นซอร์ส.

โครงการ COVID Care Map พยายามที่จะคาดการณ์และดำเนินการเพื่อเรียกการสนับสนุนการดูแลอย่างมีประสิทธิภาพสำหรับการติดเชื้อจำนวน COVID-19 ที่เพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วและผู้ที่ต้องการการดูแลอย่างเข้มงวด.

Locale.ai

Locale.ai ได้พัฒนาโอเพนซอร์ซเรชั่นวิชวลไลเซชันทุกกรณีที่ยืนยันแล้วของ COVID-19 ทั่วโลก มันสืบค้นชุดข้อมูลโอเพ่นซอร์สจาก John Hopkins University.

Locale.ai ได้พัฒนา เว็บไซต์สร้างภาพ COVID-19 โดยการใช้ Vue.js ซึ่งเป็นเฟรมเวิร์กยอดนิยมที่ช่วยให้นักพัฒนาสามารถสร้างเว็บแอปที่ทันสมัย.

COVID-19 ทั่วโลก

แอพนี้ ใช้การสร้างภาพแผนที่เพื่อติดตามการแพร่กระจายของ COVID-19 กรณีที่ได้รับการยืนยันและการพัฒนาของโรคทั่วโลก มันใช้ประโยชน์จากข้อมูลจาก John Hopkins CSSE.

ตัวติดตาม Coronavirus

นี่คือแอพ Shiny ที่พัฒนาโดย John Coene ติดตามการแพร่กระจายของ COVID-19 โดยใช้ข้อมูลจาก John Hopkins, DXY data และ Weixin แอพแสดงจำนวนผู้ต้องสงสัยยืนยันและกู้คืนเคสตามเวลาและภูมิภาค รหัสมีอยู่ใน Github.

COVID-19 คดีทั่วโลก

COVID-19 คดีทั่วโลก คือแอพ Shiny ที่พัฒนาโดย Christoph Schoenenberger ที่แสดงการพัฒนาของ COVID-19 บนแผนที่พล็อตตารางสรุปและตัวเลข รหัสของมันมีอยู่ใน Github.

รัฐบาลและ COVID-19

นี่คือแอพ Shiny ที่พัฒนาโดย Sebastian Engel-Wolf. มันแสดงแผนที่การเติบโตแบบทวีคูณ COVID-19, วันที่จะติดเชื้อซ้ำสองครั้ง, ผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน, อัตราการตายและจำนวนผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันต่อ 100,000 คนในภูมิภาคต่างๆ รหัสนี้มีอยู่ใน Github.

ห่อ

ชุมชนโอเพ่นซอร์สได้ตอบสนองต่อการระบาดใหญ่ของ COVID-19 อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ หลายโครงการได้ถูกสร้างขึ้นและถูกสร้างขึ้นเพื่อจัดการกับการแพร่กระจายของโรค บทความนี้อธิบายบางโครงการ ยังมีความไม่แน่นอนเกี่ยวกับโรคที่จะเกิดขึ้นในอีกไม่กี่สัปดาห์ข้างหน้า โครงการอื่น ๆ ที่สามารถใช้ประโยชน์จากเทคโนโลยีโอเพนซอร์ซที่มีอยู่จะค้นหาสถานที่ในการต่อสู้กับโรคร้ายนี้.

อยู่อย่างปลอดภัย!

บทความโดยดร. Michael J. Garbade ประธานเจ้าหน้าที่บริหารการศึกษาระบบนิเวศ

Jeffrey Wilson Administrator
Sorry! The Author has not filled his profile.
follow me
    Like this post? Please share to your friends:
    Adblock
    detector
    map