20 Alat Sumber Terbuka dapat Membantu COVID-19 Cure Research

Pemerintah, ilmuwan, dan lembaga penelitian menggunakan teknologi dan inovasi untuk mengatasi COVID-19.


Alat sumber terbuka telah dikembangkan, dan beberapa terus diuji untuk mendukung upaya yang telah dikerahkan untuk meminimalkan hasil dari virus mematikan ini..

Berbagai alat sumber terbuka sudah tersedia, membantu para peneliti mempelajari tentang penyakit, mengidentifikasi penyebaran, mencegah penyebaran, dan meminimalkan penyebaran dan kematian lebih lanjut. Berbagai proyek tersedia di Ekosistem Pendidikan yang menguraikan cara menggunakan alat yang berbeda.

Artikel ini membahas beberapa alat sumber terbuka dan perpustakaan yang digunakan dalam pemantauan, pencegahan dan penahanan, diagnosis, dan pengobatan COVID-19.

COVID-19 Tracking Map

Pada bulan Januari, Pusat Ilmu Pengetahuan dan Teknik Sistem JHU meluncurkan a COVID-19 Global Tracking Map yang dengan cepat menjadi sumber tepercaya internasional dari data pandemi yang berkembang secara real-time.

Peta ini bersifat open source dan telah digunakan untuk memperkuat upaya penelitian dan visualisasi oleh organisasi media top, organisasi kecil, dan pemerintah daerah.

DXY-COVID-19-Crawler

DXY-COVID-19-Crawler adalah salah satu proyek open-source paling awal yang dikembangkan untuk menanggapi COVID-19 pada bulan Januari.

Pengembang memanfaatkan data dari DXY.cn, sebuah situs yang digunakan oleh praktisi medis Tiongkok untuk melaporkan dan melacak kasus. Mereka mengembangkan perayap web yang mengumpulkan data dari situs dan membuatnya tersedia melalui API dan gudang data. Kode tersedia pada Github.

Buka Kit Data

Open Data Kit (ODK) bukan alat baru. Ini telah digunakan sebelumnya selama wabah Ebola di Afrika Barat pada tahun 2004 dan wabah yang lebih baru di Republik Demokratik Kongo pada tahun 2019.

Ini terutama membantu pengguna mengumpulkan, mengelola, dan menggunakan data dalam pelacakan kontak, pemetaan strategis, dukungan keputusan, kepekaan masyarakat, dan manajemen kasus.

Komunitas ODK telah mengembangkan penggunaannya sebagai tanggapan terhadap COVID-19 dengan menyediakan formulir pelaporan dalam penyebarannya. Formulir ini dirancang sesuai dengan protokol Organisasi Kesehatan Dunia untuk menyelidiki kasus dan melacak kontak dan penyelidikan.

Pengembang utama juga menawarkan dukungan gratis untuk organisasi apa pun yang menggunakan ODK sebagai tanggapan terhadap COVID-19.

Ketegangan berikutnya

Ketegangan berikutnya melacak evolusi patogen. Ini sebelumnya telah digunakan untuk mengetahui sejarah keluarga suatu penyakit, sehingga memungkinkan prediksi perkembangan penyakit.

Ini telah berhasil digunakan dalam epidemi sebelumnya, seperti Ebola. Melalui data genetik dari Global Initiative on Sharing All Influenza Data (Gisaid), Nextxtrain digunakan untuk mengatasi COVID-19.

DHIS2

Anda mungkin sudah tahu DHIS2. Ini adalah Sistem Manajemen Informasi Kesehatan terbesar di dunia. Ini digunakan di lebih dari 70 negara. Sebagai bagian dari tanggapan terhadap COVID-19, DHIS2 telah merilis paket data digital yang mempercepat deteksi infeksi, pelaporan, pengawasan, dan pengobatan penyakit..

Paket data digital DHIS2 memanfaatkan metadata standar yang selaras dengan protokol WHO tentang definisi kasus COVID-19 dan pengawasan untuk memungkinkan penyebaran dan respons yang cepat.

Pikobar Jawa Barat

Pusat Informasi dan Koordinasi Indonesia untuk Penyakit dan Bencana adalah pusat respons krisis yang dibentuk untuk memitigasi dan menanggapi COVID-19 di provinsi Jawa Barat, Indonesia.

Layanan Digital Jabar, sebagai bagian dari tanggapan, telah mengembangkan suatu alat dan aplikasi web open-source yang memungkinkan pengguna untuk mengakses data COVID-19 terbaru.

OpenMRS

OpenMRS adalah sistem perawatan pasien yang digunakan di banyak negara berkembang di seluruh dunia. Karena fleksibilitas Sistem OpenMRS, negara-negara yang memiliki sumber daya kesehatan yang tegang dapat menggunakannya untuk pengawasan, skrining, dan pengobatan COVID-19.

Sistem ini dapat membantu mereka memperluas kapasitas mereka dengan memberi mereka akses ke informasi berbasis ilmiah tentang cara menangani krisis.

OpenLMIS

Itu Proyek OpenLMIS memanfaatkan taktik yang berfokus pada masyarakat untuk mengembangkan sumber terbuka dan sistem informasi manajemen logistik yang dapat disesuaikan. Sistem OpenLMIS berupaya untuk meningkatkan akurasi data, meningkatkan akuntabilitas, meningkatkan ketepatan waktu data, dan visibilitas.

Sistem OpenLMIS berupaya untuk meningkatkan rantai pasokan kesehatan, inventarisasi sumber daya medis untuk memberikan gambaran yang jelas tentang pasokan medis yang tersedia, termasuk kit uji, dan PPE (alat pelindung diri). Alat ini dapat secara efektif digunakan untuk mendukung pengambil keputusan dalam mengalokasikan sumber daya sebagai tanggapan terhadap COVID-19.

Situs kesehatan

Itu Proyek Pemetaan Situs Kesehatan Global adalah proyek yang bertujuan memetakan setiap fasilitas kesehatan di dunia dan membuat detail setiap rumah sakit mudah diakses. Data fasilitas kesehatan telah dapat diakses melalui API.

Dengan berkolaborasi dengan pengguna, tim healthsites.io menangkap dan memvalidasi lokasi dan detail kontak masing-masing fasilitas kesehatan dan membuat data tersedia secara bebas dan dapat diakses melalui Lisensi Data Terbuka..

SORMAS

SORMAS (Sistem Analisis dan Manajemen Respons Wabah Surveillance) adalah sistem e-kesehatan seluler open-source. Ini telah dikerahkan untuk menerapkan pengendalian penyakit serta prosedur manajemen wabah.

Ini telah secara efektif digunakan di beberapa negara, termasuk Ghana, Nigeria, Nepal, dan Fiji, untuk pengawasan COVID-19 dan deteksi dini.

SORMAS adalah sistem sumber terbuka gratis yang mengikuti standar perlindungan data.

Tokyo COVID-19

Tidak seperti banyak kota dan pemerintah lain, kota Pemerintah Metropolitan Tokyo telah mengembangkan situs web sumber terbuka yang menginformasikan penghuninya tentang COVID-19. Dengan menjadikannya open-source, situs ini telah melihat kontribusi dari lebih dari 200 pengguna. Tiga kota lain, Chiba, Nagano, dan Fukuoka, telah membuat ulang situs web.

OpenELIS

Tujuan dari Sistem kesehatan OpenELIS adalah untuk meningkatkan layanan kesehatan dengan menyediakan sistem manajemen informasi laboratorium progresif berbasis standar yang dapat digunakan oleh berbagai inisiatif kesehatan untuk meningkatkan pilihan perawatan.

Wabah COVID-19 telah menghadirkan tantangan global pelacakan kontak dan pengujian massal terhadap kasus-kasus yang dicurigai. Sistem OpenELIS secara efektif dapat digunakan dalam menangani COVID-19 untuk memfasilitasi pelacakan tes dan hasil laboratorium.

Perangkat Kesehatan Masyarakat

Itu Perangkat Kesehatan Masyarakat adalah kumpulan alat sumber terbuka serta sumber daya akses terbuka yang menargetkan untuk membangun dan menggunakan alat digital untuk digunakan dalam prakarsa kesehatan masyarakat di bidang yang sulit dijangkau.

Komunitas pengembang Community Health Toolkit telah memobilisasi untuk mengembangkan alat dan sumber daya yang bertujuan mendukung pekerja kesehatan masyarakat untuk mengatasi COVID-19.

BERBUNYI

Itu COVID-19 Model Dampak Rumah Sakit untuk Epidemi (CHIME) adalah aplikasi open-source yang dikembangkan oleh para ilmuwan data di Penn Medicine – University of Pennsylvania. Ini adalah alat online yang memungkinkan rumah sakit untuk memprediksi dampak virus pada sumber daya kesehatan.

Ini dikembangkan menggunakan Python dan dependensi open-source panda.

Peta Perawatan COVID

Itu Peta Perawatan COVID membantu memetakan sumber daya perawatan kesehatan yang sudah ada dan dalam memperkirakan kesenjangan di tempat tidur rumah sakit, ventilator, persediaan medis, dan staf. Semua metode, alat pemrosesan data, visualisasi, dan kode sumber gratis dan open-source.

Proyek COVID Care Map berupaya mengantisipasi dan bertindak untuk memanggil dukungan untuk secara efektif merawat jumlah infeksi COVID-19 yang berkembang pesat dan mereka yang membutuhkan perawatan intensif.

Lokal.saya

Locale.ai telah mengembangkan visualisasi sumber terbuka dan interaktif dari semua kasus COVID-19 yang dikonfirmasi di seluruh dunia. Itu pertanyaan dataset sumber terbuka dari Universitas John Hopkins.

Locale.ai mengembangkan Situs web visualisasi COVID-19 dengan menggunakan Vue.js, yang merupakan kerangka kerja populer yang memungkinkan pengembang untuk membuat aplikasi web modern.

COVID-19 di seluruh dunia

Aplikasi ini memanfaatkan visualisasi peta untuk memantau penyebaran COVID-19, kasus yang dikonfirmasi, dan perkembangan penyakit di seluruh dunia. Itu menggunakan data dari John Hopkins CSSE.

Pelacak coronavirus

Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh John Coene. Ini melacak penyebaran COVID-19 dengan menggunakan data dari John Hopkins, data DXY, dan Weixin. Aplikasi ini menunjukkan jumlah kasus yang dicurigai, dikonfirmasi, dan dipulihkan berdasarkan waktu dan wilayah. Kode tersedia pada Github.

COVID-19 Kasus Global

COVID-19 Kasus Global adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Christoph Schoenenberger yang menunjukkan perkembangan COVID-19 pada peta, plot, tabel ringkasan, dan angka. Kodenya tersedia di Github.

Pemerintah dan COVID-19

Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Sebastian Engel-Wolf. Ini memetakan pertumbuhan eksponensial COVID-19, hari untuk menggandakan infeksi, kasus yang dikonfirmasi, tingkat kematian, dan jumlah kasus yang dikonfirmasi per 100.000 orang di berbagai daerah. Kode tersedia di Github.

Membungkus

Komunitas open-source merespons pandemi COVID-19 dengan cepat dan efektif. Banyak proyek telah dibangun dan terus dibangun untuk mengatasi penyebaran penyakit. Artikel ini menjelaskan beberapa proyek. Masih ada ketidakpastian tentang bagaimana penyakit ini akan berkembang dalam beberapa minggu mendatang. Lebih banyak proyek yang dapat memanfaatkan teknologi open-source yang ada akan menemukan tempat dalam perang melawan penyakit mematikan ini.

Tetap aman!

Artikel oleh Dr. Michael J. Garbade, CEO, Ekosistem Pendidikan

Jeffrey Wilson Administrator
Sorry! The Author has not filled his profile.
follow me
    Like this post? Please share to your friends:

    20 Alat Sumber Terbuka dapat Membantu COVID-19 Cure Research

    Pemerintah, ilmuwan, dan lembaga penelitian menggunakan teknologi dan inovasi untuk mengatasi COVID-19.


    Alat sumber terbuka telah dikembangkan, dan beberapa terus diuji untuk mendukung upaya yang telah dikerahkan untuk meminimalkan hasil dari virus mematikan ini..

    Berbagai alat sumber terbuka sudah tersedia, membantu para peneliti mempelajari tentang penyakit, mengidentifikasi penyebaran, mencegah penyebaran, dan meminimalkan penyebaran dan kematian lebih lanjut. Berbagai proyek tersedia di Ekosistem Pendidikan yang menguraikan cara menggunakan alat yang berbeda.

    Artikel ini membahas beberapa alat sumber terbuka dan perpustakaan yang digunakan dalam pemantauan, pencegahan dan penahanan, diagnosis, dan pengobatan COVID-19.

    COVID-19 Tracking Map

    Pada bulan Januari, Pusat Ilmu Pengetahuan dan Teknik Sistem JHU meluncurkan a COVID-19 Global Tracking Map yang dengan cepat menjadi sumber tepercaya internasional dari data pandemi yang berkembang secara real-time.

    Peta ini bersifat open source dan telah digunakan untuk memperkuat upaya penelitian dan visualisasi oleh organisasi media top, organisasi kecil, dan pemerintah daerah.

    DXY-COVID-19-Crawler

    DXY-COVID-19-Crawler adalah salah satu proyek open-source paling awal yang dikembangkan untuk menanggapi COVID-19 pada bulan Januari.

    Pengembang memanfaatkan data dari DXY.cn, sebuah situs yang digunakan oleh praktisi medis Tiongkok untuk melaporkan dan melacak kasus. Mereka mengembangkan perayap web yang mengumpulkan data dari situs dan membuatnya tersedia melalui API dan gudang data. Kode tersedia pada Github.

    Buka Kit Data

    Open Data Kit (ODK) bukan alat baru. Ini telah digunakan sebelumnya selama wabah Ebola di Afrika Barat pada tahun 2004 dan wabah yang lebih baru di Republik Demokratik Kongo pada tahun 2019.

    Ini terutama membantu pengguna mengumpulkan, mengelola, dan menggunakan data dalam pelacakan kontak, pemetaan strategis, dukungan keputusan, kepekaan masyarakat, dan manajemen kasus.

    Komunitas ODK telah mengembangkan penggunaannya sebagai tanggapan terhadap COVID-19 dengan menyediakan formulir pelaporan dalam penyebarannya. Formulir ini dirancang sesuai dengan protokol Organisasi Kesehatan Dunia untuk menyelidiki kasus dan melacak kontak dan penyelidikan.

    Pengembang utama juga menawarkan dukungan gratis untuk organisasi apa pun yang menggunakan ODK sebagai tanggapan terhadap COVID-19.

    Ketegangan berikutnya

    Ketegangan berikutnya melacak evolusi patogen. Ini sebelumnya telah digunakan untuk mengetahui sejarah keluarga suatu penyakit, sehingga memungkinkan prediksi perkembangan penyakit.

    Ini telah berhasil digunakan dalam epidemi sebelumnya, seperti Ebola. Melalui data genetik dari Global Initiative on Sharing All Influenza Data (Gisaid), Nextxtrain digunakan untuk mengatasi COVID-19.

    DHIS2

    Anda mungkin sudah tahu DHIS2. Ini adalah Sistem Manajemen Informasi Kesehatan terbesar di dunia. Ini digunakan di lebih dari 70 negara. Sebagai bagian dari tanggapan terhadap COVID-19, DHIS2 telah merilis paket data digital yang mempercepat deteksi infeksi, pelaporan, pengawasan, dan pengobatan penyakit..

    Paket data digital DHIS2 memanfaatkan metadata standar yang selaras dengan protokol WHO tentang definisi kasus COVID-19 dan pengawasan untuk memungkinkan penyebaran dan respons yang cepat.

    Pikobar Jawa Barat

    Pusat Informasi dan Koordinasi Indonesia untuk Penyakit dan Bencana adalah pusat respons krisis yang dibentuk untuk memitigasi dan menanggapi COVID-19 di provinsi Jawa Barat, Indonesia.

    Layanan Digital Jabar, sebagai bagian dari tanggapan, telah mengembangkan suatu alat dan aplikasi web open-source yang memungkinkan pengguna untuk mengakses data COVID-19 terbaru.

    OpenMRS

    OpenMRS adalah sistem perawatan pasien yang digunakan di banyak negara berkembang di seluruh dunia. Karena fleksibilitas Sistem OpenMRS, negara-negara yang memiliki sumber daya kesehatan yang tegang dapat menggunakannya untuk pengawasan, skrining, dan pengobatan COVID-19.

    Sistem ini dapat membantu mereka memperluas kapasitas mereka dengan memberi mereka akses ke informasi berbasis ilmiah tentang cara menangani krisis.

    OpenLMIS

    Itu Proyek OpenLMIS memanfaatkan taktik yang berfokus pada masyarakat untuk mengembangkan sumber terbuka dan sistem informasi manajemen logistik yang dapat disesuaikan. Sistem OpenLMIS berupaya untuk meningkatkan akurasi data, meningkatkan akuntabilitas, meningkatkan ketepatan waktu data, dan visibilitas.

    Sistem OpenLMIS berupaya untuk meningkatkan rantai pasokan kesehatan, inventarisasi sumber daya medis untuk memberikan gambaran yang jelas tentang pasokan medis yang tersedia, termasuk kit uji, dan PPE (alat pelindung diri). Alat ini dapat secara efektif digunakan untuk mendukung pengambil keputusan dalam mengalokasikan sumber daya sebagai tanggapan terhadap COVID-19.

    Situs kesehatan

    Itu Proyek Pemetaan Situs Kesehatan Global adalah proyek yang bertujuan memetakan setiap fasilitas kesehatan di dunia dan membuat detail setiap rumah sakit mudah diakses. Data fasilitas kesehatan telah dapat diakses melalui API.

    Dengan berkolaborasi dengan pengguna, tim healthsites.io menangkap dan memvalidasi lokasi dan detail kontak masing-masing fasilitas kesehatan dan membuat data tersedia secara bebas dan dapat diakses melalui Lisensi Data Terbuka..

    SORMAS

    SORMAS (Sistem Analisis dan Manajemen Respons Wabah Surveillance) adalah sistem e-kesehatan seluler open-source. Ini telah dikerahkan untuk menerapkan pengendalian penyakit serta prosedur manajemen wabah.

    Ini telah secara efektif digunakan di beberapa negara, termasuk Ghana, Nigeria, Nepal, dan Fiji, untuk pengawasan COVID-19 dan deteksi dini.

    SORMAS adalah sistem sumber terbuka gratis yang mengikuti standar perlindungan data.

    Tokyo COVID-19

    Tidak seperti banyak kota dan pemerintah lain, kota Pemerintah Metropolitan Tokyo telah mengembangkan situs web sumber terbuka yang menginformasikan penghuninya tentang COVID-19. Dengan menjadikannya open-source, situs ini telah melihat kontribusi dari lebih dari 200 pengguna. Tiga kota lain, Chiba, Nagano, dan Fukuoka, telah membuat ulang situs web.

    OpenELIS

    Tujuan dari Sistem kesehatan OpenELIS adalah untuk meningkatkan layanan kesehatan dengan menyediakan sistem manajemen informasi laboratorium progresif berbasis standar yang dapat digunakan oleh berbagai inisiatif kesehatan untuk meningkatkan pilihan perawatan.

    Wabah COVID-19 telah menghadirkan tantangan global pelacakan kontak dan pengujian massal terhadap kasus-kasus yang dicurigai. Sistem OpenELIS secara efektif dapat digunakan dalam menangani COVID-19 untuk memfasilitasi pelacakan tes dan hasil laboratorium.

    Perangkat Kesehatan Masyarakat

    Itu Perangkat Kesehatan Masyarakat adalah kumpulan alat sumber terbuka serta sumber daya akses terbuka yang menargetkan untuk membangun dan menggunakan alat digital untuk digunakan dalam prakarsa kesehatan masyarakat di bidang yang sulit dijangkau.

    Komunitas pengembang Community Health Toolkit telah memobilisasi untuk mengembangkan alat dan sumber daya yang bertujuan mendukung pekerja kesehatan masyarakat untuk mengatasi COVID-19.

    BERBUNYI

    Itu COVID-19 Model Dampak Rumah Sakit untuk Epidemi (CHIME) adalah aplikasi open-source yang dikembangkan oleh para ilmuwan data di Penn Medicine – University of Pennsylvania. Ini adalah alat online yang memungkinkan rumah sakit untuk memprediksi dampak virus pada sumber daya kesehatan.

    Ini dikembangkan menggunakan Python dan dependensi open-source panda.

    Peta Perawatan COVID

    Itu Peta Perawatan COVID membantu memetakan sumber daya perawatan kesehatan yang sudah ada dan dalam memperkirakan kesenjangan di tempat tidur rumah sakit, ventilator, persediaan medis, dan staf. Semua metode, alat pemrosesan data, visualisasi, dan kode sumber gratis dan open-source.

    Proyek COVID Care Map berupaya mengantisipasi dan bertindak untuk memanggil dukungan untuk secara efektif merawat jumlah infeksi COVID-19 yang berkembang pesat dan mereka yang membutuhkan perawatan intensif.

    Lokal.saya

    Locale.ai telah mengembangkan visualisasi sumber terbuka dan interaktif dari semua kasus COVID-19 yang dikonfirmasi di seluruh dunia. Itu pertanyaan dataset sumber terbuka dari Universitas John Hopkins.

    Locale.ai mengembangkan Situs web visualisasi COVID-19 dengan menggunakan Vue.js, yang merupakan kerangka kerja populer yang memungkinkan pengembang untuk membuat aplikasi web modern.

    COVID-19 di seluruh dunia

    Aplikasi ini memanfaatkan visualisasi peta untuk memantau penyebaran COVID-19, kasus yang dikonfirmasi, dan perkembangan penyakit di seluruh dunia. Itu menggunakan data dari John Hopkins CSSE.

    Pelacak coronavirus

    Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh John Coene. Ini melacak penyebaran COVID-19 dengan menggunakan data dari John Hopkins, data DXY, dan Weixin. Aplikasi ini menunjukkan jumlah kasus yang dicurigai, dikonfirmasi, dan dipulihkan berdasarkan waktu dan wilayah. Kode tersedia pada Github.

    COVID-19 Kasus Global

    COVID-19 Kasus Global adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Christoph Schoenenberger yang menunjukkan perkembangan COVID-19 pada peta, plot, tabel ringkasan, dan angka. Kodenya tersedia di Github.

    Pemerintah dan COVID-19

    Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Sebastian Engel-Wolf. Ini memetakan pertumbuhan eksponensial COVID-19, hari untuk menggandakan infeksi, kasus yang dikonfirmasi, tingkat kematian, dan jumlah kasus yang dikonfirmasi per 100.000 orang di berbagai daerah. Kode tersedia di Github.

    Membungkus

    Komunitas open-source merespons pandemi COVID-19 dengan cepat dan efektif. Banyak proyek telah dibangun dan terus dibangun untuk mengatasi penyebaran penyakit. Artikel ini menjelaskan beberapa proyek. Masih ada ketidakpastian tentang bagaimana penyakit ini akan berkembang dalam beberapa minggu mendatang. Lebih banyak proyek yang dapat memanfaatkan teknologi open-source yang ada akan menemukan tempat dalam perang melawan penyakit mematikan ini.

    Tetap aman!

    Artikel oleh Dr. Michael J. Garbade, CEO, Ekosistem Pendidikan

    Jeffrey Wilson Administrator
    Sorry! The Author has not filled his profile.
    follow me
      Like this post? Please share to your friends:
      Adblock
      detector
      map